山东省兰陵县羊粪中产志贺毒素2k新亚型大肠埃希菌的检出及其分子特征分析

更新时间:2023-05-28

《中华微生物学和免疫学杂志》2020年05期

【摘要】目的了解山东省兰陵县羊携带志贺毒素基因stx2k新亚型大肠埃希菌的情况及其分子特征。方法 2019年11月采集山东省兰陵县不同养殖户的羊粪便512份,经EC肉汤增菌后PCR检测stx基因,阳性样品分别接种科玛嘉(CHROMagar?)ECC及科玛嘉(CHROMagar?)STEC培养基,对stx基因阳性菌株进行全基因组测序。根据基因组数据分析菌株stx基因亚型、血清型、多位点序列分型(MLST)情况及毒力基因携带情况。结果从512份羊粪中共分离86株产志贺毒素大肠埃希菌,包括5种不同的stx亚型,其中stx2k亚型菌株37株;86株菌分为20种O∶H血清型及18种不同ST型。结论山东省兰陵县羊携带的产志贺毒素大肠埃希菌在志贺毒素亚型、血清型及毒力基因等分子特征方面存在多样性,且检出了产志贺毒素2k新亚型的大肠埃希菌。

【关键词】产志贺毒素大肠埃希菌志贺毒素2k 全基因组测序